El Pleno es el Órgano de Gobierno del Tribunal de Justicia Administrativa del Estado de Guanajuato, integrado por los Magistrados en funciones los cuales tienen derecho a voz y voto. Es necesario la presencia de la mayoría de los Magistrados para que sesione válidamente. Se auxilia del Secretario General de Acuerdos, quien da fe de lo actuado en las sesiones y tiene derecho a voz pero no a voto.
Las sesiones del Pleno del Tribunal de Justicia Administrativa del Estado de Guanajuato se celebrarán en los días y horas que fije el Reglamento Interior del Tribunal, serán públicas, se transmitirán por los medios electrónicos que faciliten su seguimiento a través de videograbación y se harán versiones públicas para la consulta ciudadana que, en su caso, sea requerida.